肝穿刺既是一種檢查方法，也是一種治療手段。

作為檢查主要是指肝穿刺活檢。當臨床遇有一些診斷不明的肝臟疾患時，可考慮做肝穿刺活檢。如疑為肝炎而難以確診者或需進行病理檢查協助分型者；長期低熱病例，經全面檢查已排除其他病患，考慮為肝病所致者；肝腫大和（或）脾腫大原因不明者，或需與肝結核、脂肪肝等疾患相鑒別者；病毒性與藥物性所致肝損害情況不明者等。另外，肝膿腫患者可通過肝穿刺抽出膿液，明確診斷。

一般肝穿刺活檢時， 盡可能細針穿刺，負壓抽吸細胞或組織。所需儀器或設備少，對工藝要求也相對簡單。

作為一種治療手段，主要是通過經皮肝穿刺導入導絲，引流管， 膽道支架， 球囊等設備對肝膿腫，膽結石，阻塞性黃疸，膽道狹窄進行后續治療。

肝穿刺是一種有創操作，由于肝臟是實體器官，是體內最大的儲血器官（門靜脈， 肝動脈雙重供血，通過肝靜脈流出） 還有肝內膽管，淋巴等管道系統，可能引起一些相應的并發癥和危害，最常見的是出血，嚴重者甚至可以引起肝臟血腫。其次是肝臟的損傷，操作過程如果多次反復進行穿刺，會造成穿刺部位肝臟組織破碎，因而損傷肝臟。另外，還可能造成膽漏以及腫瘤的針道轉移等。所以在做肝穿刺時盡可能細針穿刺，減少不必要的損傷。

肝穿刺操作可通過一步法和二步法實現，我們提倡二步法操作即先用細針穿刺，特別是通過肝穿刺建立通路處理膽道病變時，待穿刺成功后，先導入細導絲，再逐步引入導入鞘管和0.038英寸的粗導絲。另外在進行手術前的1~2天，需做好充分的準備，患者需要進行一些常規肝臟的生化檢查以及凝血功能的檢測，還要進行血常規和血小板的檢測，在手術前的一天要用超聲來定位穿刺點，了解穿刺點的周圍有沒有比較大的血管或者是腫大的膽囊。在進行肝穿刺以后需要住院休息幾天。